Jönköping Academy grundades 2009 som ett gemensamt initiativ av Jönköping University, Region Jönköpings län och länets kommuner. Verksamheten etablerades vid Hälsohögskolan med en gemensam ambition att stärka utvecklingen av hälsa, vård och omsorg genom forskning, utbildning och nära samverkan med praktiken. Syftet var att bygga en akademisk miljö för kvalitetsförbättring, där kunskap utvecklas tillsammans med patienter, närstående, professioner och verksamheter, med målet att skapa nytta för dem som vården och omsorgen finns till för.

Inom ramen för Jönköping Academy utvecklades såväl masterprogrammet i Kvalitetsförbättring och ledarskap inom hälsa och välfärd som en tillhörande forskningsmiljö. Utbildningen drivs idag av avdelningen för Kvalitetsförbättring och ledarskap vid Hälsohögskolan och forskningsmiljön Jönköping Academy idag är en del av Futurum – Region Jönköpings läns forsknings- och utvecklingsverksamhet.

Jönköping Academy fortsätter att verka i nära samarbete med universitet, högskolor och andra aktörer, regionalt, nationellt och internationellt. Den ursprungliga visionen lever vidare: att genom forskning, lärande och samverkan bidra till en bättre hälsa och en ständigt förbättrad vård och omsorg.